当甲状腺无法制造足量的甲状腺激素供给身体所需时，即称为甲状腺功能减退。造成甲状腺功能减退的主要原因有甲状腺切除、放射碘治疗的后遗症、甲状腺炎造成的甲状腺破坏、先天性甲状腺缺如、异位甲状腺等。

甲状腺功能减退的症状与甲状腺功能亢进刚好相反，主要造成身体的新陈代谢率降低，一切细胞活动都迟缓下来，病人会表现出食欲不振、怕冷、皮肤干而粗糙、头发脆弱、疲倦、便秘，甚至肌肉无力、声音低沉沙哑等。体检可发现脉搏变慢、眼睑水肿、面色苍白、皮肤稍黄、记忆力减退等。

临床上治疗甲状腺功能减退主要使用人工合成的甲状腺激素(如优甲乐、甲状腺素片等)，它一般不会造成，也很少引起过敏反应，剂量因人而异。服药期间需定期验血，以监测药物是否足量。由于甲状腺功能减退往往是由不可逆或性的损害所造成的，所以多数甲状腺功能减退的病人需要终生服用甲状腺激素治疗而不能任意停药，尤其在怀孕期间，此时母亲对甲状腺的需求增加，若补充不足，会影响胎儿生长。