提到免疫清除期就必须提到免疫耐受期，免疫耐受期俗称携带，就是肝脏内的病毒与免疫系统和平相处，没有识别攻击，进而没有损害。

免疫清除期主要是人体的免疫功能发挥作用了，要清除乙肝病毒，这时肝脏细胞也会受到损伤，表现为病毒复制减少、肝功能不正常，肝脏B超正常。

好处是这个阶段有可能会利用人体的免疫功能发生病毒的清除，配合药物治疗，大三阳转为小三阳，病毒复制受到控制即HBV DNA阴性，传染性显著减小，肝脏损害会修复并且保持稳定，并且还可达病毒转阴，甚至抗体抗原转换。

坏处这个阶段人体不会感到什么不适，要是等到发现后为时已晚了。还有一点是通常免疫细胞还不能彻底清除乙肝病毒，这样会令肝功能持续受到伤害，加上没有正规治疗或者不重视，容易使病情发展。