根据病毒复制水平、机体免疫系统状态和肝损害情况，乙型肝炎的疾病发展过程一般可人为地划分为4个期，即免疫耐受期、免疫清除期、非活动期或低非复制期和再活动期。

1. 免疫耐受期

此时人体免疫系统并不能检测出乙肝病毒，因此淋巴细胞、抗体等不会将乙肝病毒清除出去，乙肝病毒也不会影响肝功能，更不会加以损伤，这个时候也往往是较为安全的时期，乙肝携带者就是处于这个时期。

2. 在免疫清除期

这个时期，人体的免疫系统检测出乙肝病毒以后，就会产生相应的抗体和免疫细胞，这些抗体根据相应的特征识别乙肝病毒，并且与之结合，产生抗体复合物，并被吞噬细胞吞噬而后排出体外。

人体肝功能一般就受到了损伤，需要施加药物或其他方法进行治疗了。

3. 在非活动期

在抗体和吞噬细胞的努力之下，大部分的乙肝病毒都被清除出了体外，而且此时的免疫系统也监测不到乙肝病毒了，但是仍然有少部分的乙肝病毒残留，不过他们进入了潜伏期。

加上肝细胞有丝分裂加倍的速度变缓，这一时期，乙肝病毒对身体几乎没有损伤。

4. 在活动期

在活动期内，在某种特定因素的诱导下，乙肝病毒会再次发威，形成炎症，损伤肝细胞，进而影响身体的正常功能。