尿石的形态取决于成石时的环境和条件。从某种意义上讲，医师可以根据尿石的形态来判断其形成的原因并相应的治疗方法。尿石形态有两种方法：一是治疗前在尿路平片上进行，主要结石的大小、外形、透光度，并据此其内部结构和成分；二是在治疗后对结石的标本进行，主要其表面和剖面的结构。
根据结石在尿路平片上的形态，可以对结石能否排出、对肾功能有无影响作出初步的估计。一般来说，带刺的结石不太容易排出，但因为晶体之间的缝隙可以让尿液通过而对肾功能的影响较小。反之，光滑的结石比较容易排出，但其表面与尿路黏膜紧紧靠近，如不能及时排出，所造成的梗阻就比较完全，对肾功能的影响也比较大。
粒晶结构的结石一般成石的时间比较短，结石比较小，结构也比较松散，其成分多数为二水草酸钙。这种结石可以进行中西医结合的排石治疗，也可以进行体外冲击波碎石治疗。
缅状结构的结石则多在比较宽敞的环境中形成，成石时间比较长，结构也比较致密。同时存在多个结石而且相互紧贴时，可见相互接触的面。其成分可以是一水草酸钙和尿酸。对这种结石在诊断时应当考虑是否合并梗阻等。虽然也可以进行中西医结合治疗，但结石排出的机会较小。对于这种结石应该采取手术治疗、体外冲击波碎石治疗或经内镜做气压弹道碎石、钦激光碎石等治疗。
复合结构的结石成石条件和环境比较复杂，有些结石内部有一个核心，周围是辆状结构，外围又是粒晶结构；有些结石则内部有一个粒品结构的核心，周围为缅状结构；有些结石是由多个小结石互相黏结在一起而形成的；有些结石合并有感染或合并有梗阻。这种结石一般比较大，表面形态也不规则，一般应该手术治疗，在手术取出结石的同时去除形成结石的因素。
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